개헌 문건을 둘러싼 논란이 확산되면서 해당 문건의 작성자인 김용익 민주연구원장이 사의를 표명했다. 특정 후보 지원과 국회의 개헌 추진을 무력화 한다는 논란에 책임을 지고 용단을 내린 것으로 보인다. 더불어민주당에 따르면 김용익 원장은 4일 오전 당 지도부에 '책임을 지겠다'는 의사를 전했다. 당 지도부는 진상조사위원회 조사결과에 따라 김 원장의 사표 수리 여부를 결정한다는 방침이다. 또한 민주당은 해당 문건을 작성한 문병주 수석연구위원을 전날 보직해임하고 대기발령 조치했다. 하지만 이 같은 지도부 조치에도 불구하고 당내 의원들의 반발은 지속되고 있다. 당내 대권후보 중 한 명인 김부겸 의원 측은 "개헌 관련 전략보고서 파동 책임은 민주연구원장이 져야 한다"며 "특정 후보 편향의 전략보고서에 대한 책임을 연구자에게 모두 돌리는 것은 전형적인 꼬리자르기"라고 지적했다. 한편 해당 문건에는 '제3지대가 구축되면 대선 승리에 위협이 된다', '대선 전 개헌 반대론에서 전략적 수정을 시도해 사전차단 또는 출구전략을 찾아야 한다' 등의 내용이 담긴 사실이 확인되면서 논란이 일었다.